為什么要改善研究生學費制度？
90年代，我國普通大學的各種本科生和大專生都實行了收費制度，但研究生正處于收費與免費并存的階段。根據《教育部和財政部國家發展和改革委員會關于進一步規范高等學校收費管理的通知》（教財[2006] 2號），允許收取的學費僅包括具有專業學位的研究生，攻讀學位的研究生和學位申請。具有相同學歷的水平，模型軟件學院的工程碩士研究生，委托培訓的自負盈虧研究生，國家招生計劃中的學位研究生不在學費范圍內。近年來，一些大學在推進研究生培訓機制改革的過程中探討了收費問題，但總的來說，我國研究生教育收費制度并不健全。
研究生教育為非義務教育，應實行以政府投資為主體，投資人應合理分擔培訓費用，多渠道籌資的投資機制。從國際經驗來看，向研究生收取學費也是一種國際慣例。我國研究生教育收費制度不完善，不利于建立非義務教育的費用分擔機制，也不利于完善研究生獎勵政策和增加研究生財政撥款，不利于鼓勵抓緊研究生潛心學習，促進研究生教育健康發展。因此，《教育計劃綱要》明確要求“建立和完善研究生教育收費制度”。根據這一要求，《意見》建議從2014年秋季學期開始，按照“新生，大學生和老方法的新方法”的原則，對所有新招收的研究生收取學費列入國家研究生招生計劃。